Shopee มีการเปลี่ยนแปลงค่าธรรมเนียมอีกครั้ง คราวนี้เป็นการเพิ่มค่าธรรมเนียมการทำธุรกรรมผ่านบัญชีธนาคาร ทั้งแบบโอนผ่านแอพ โดยเก็บจากผู้ค้ารในระบบ เมื่อลูกค้าโอนผ่านตู้ ATM หรือโอนผ่านธนาคาร คิดเป็น 2% ของยอดเงินที่ผู้ซื้อต้องชำระบวกค่าขนส่งสินค้าที่ผู้ซื้อชำระเงิน มีผลบังคับใช้ 16 ตุลาคมนี้ ซึ่งแต่เดิมค่าธรรมเนียมส่วนโอนผ่านธนาคารนี้ไม่มีการคิดเพิ่ม

นอกจากนี้ยังเพิ่มค่าธรรมเนียมการขายด้วย ในสินค้าในหมวดหมู่อิเล็กทรอนิกส์ ค่าธรรมเนียมการขายคิดเป็น 3% (จากเดิม 1%) ส่วนสินค้าที่ไม่อยู่ในหมวดหมู่อิเล็กทรอนิกส์ ค่าธรรมเนียมการขายคิดเป็น 5% (จากเดิม 3%)

Shopee มีการเพิ่มค่าธรรมเนียมมาก่อนหน้านี้ช่วงกลางปี 2019 คือเพิ่มในส่วนของธุรกรรมบัตรเครดิตและเดบิตจากผู้ขาย