ผู้ใช้หลาย ๆ คนอาจจะปิดตัวอัพเดทอัตโนมัติของวินโดวส์ทั้ง XP และวิสต้าเนื่องจากหลาย ๆ สาเหตุที่ต่างกัน สำหรับบริษัทบางบริษัทคอมพิวเตอร์แต่ละเครื่องจำเป็นที่จะต้องมีอัพเดทที่สามารถทำงานด้วยกันได้เพราะฉะนั้นการตรวจสอบเวอร์ชั่นของอัพเดทต่าง ๆ มีความสำคัญค่อนข้างสูง

ล่าสุดโปรแกรม Windows Update ได้ทำการเปลี่ยนแปลงไฟล์จำนวน 9 ไฟล์บนเครื่องคอมพิวเตอร์ที่ติดตั้งระบบปฏิบัติการวินโดวส์ XP และวิสต้าโดยไม่ได้รับอนุญาตแม้ว่าจะทำการปิดฟังก์ชั่นอัพเดทอัตโนมัติแล้วใน Control Panel ก็ตาม นอกจากนี้ยังไม่ได้มีการสื่อสารถึงผู้ใช้แต่อย่างใดว่ามีการอัพเดทเกิดขึ้น