แอปเปิลยังไม่ยอมเผยรายละเอียดของ Apple Pay แต่เว็บไซต์ด้านเทคโนโลยีการเงิน Bank Innovation ได้นั่งคุยกับ MasterCard ซึ่งเป็นพันธมิตรรายหนึ่งของแอปเปิล และได้ข้อมูลว่า Apple Pay มีกระบวนการทำงานอย่างไร

ตามปกติแล้ว บัตรเครดิตที่มีชิป EMV ในตัวจะสร้างรหัสแบบสุ่มที่เรียก cryptogram ขึ้นมาทุกครั้งที่ทำธุรกรรม โดยรหัสนี้จะถูกสุ่มจากชิปบนบัตร แล้วส่งไปยังธนาคารผู้ออกบัตร (ร่วมกับหมายเลขบัญชีของลูกค้าผู้รูดบัตร) เพื่อประมวลผล

ต่อจากข่าวลือว่าธนาคารต้องจ่ายค่าธรรมเนียมให้แอปเปิลเพื่อใช้ Apple Pay ล่าสุดหนังสือพิมพ์ Financial Times ได้ข้อมูลอย่างไม่เป็นทางการแล้วว่า แอปเปิลจะได้ส่วนแบ่ง 0.15% จากธุรกรรมที่ผ่านระบบ Apple Pay

ข้อมูลของ Financial Times บอกว่า Eddy Cue ผู้บริหารของแอปเปิลที่ดูแล App Store และ iTunes เป็นคนคุมการเจรจากับธนาคารและบริษัทบัตรเครดิตมาเป็นเวลากว่าหนึ่งปีแล้ว โดยโครงการนี้เก็บเป็นความลับสุดยอด และพนักงานของธนาคารที่ทำระบบไอทีให้โครงการนี้ก็ไม่รู้ว่ากำลังทำงานอะไรอยู่